El aeropuerto de Puerto Vallarta cuenta con el servicio Aviación Ejecutiva proporcionado por una empresa externa a GAP llamada Aerotron.
Aerotron se encuentra localizado dentro de las instalaciones del propio aeropuerto, ofreciendo una gran variedad de servicios que incluye: un hangar de 3,000 pies cuadrados y una rampa recientemente ampliada y construida con calidad y tecnología de punta con una superficie de 60,000 pies cuadrados, así como los camiones Gas avión y Jet A.
La base de operaciones cuenta con una sala VIP y áreas para la tripulación, además de contratación de hoteles, salas de descanso, etc.